Konkrétně tyto 2 moduly/tabulky:

http://docs.phpmyadmin.net/en/latest/config.html#cfg_Servers_recent

http://docs.phpmyadmin.net/en/latest/config.html#cfg_Servers_table_uiprefs

V configu v  /etc/phpmyadmin/config.inc.php je potřeba povolit následující řádky:

$cfg[‚Servers‘][$i][‚recent‘] = ‚pma_recent‘;

$cfg[‚Servers‘][$i][‚table_uiprefs‘] = ‚pma_table_uiprefs‘;

$cfg[‚Servers‘][$i][‚recent‘] = ‚pma_recent‘;

Potom lognout na phpmyadmina a v databázi phpmyadminu přejít do záložky sql a vložit tam tohle:

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `pma_recent` (
  `username` varchar(64) NOT NULL,
  `tables` text NOT NULL,
  PRIMARY KEY (`username`)
)
  COMMENT='Recently accessed tables'
  DEFAULT CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_bin;

-- --------------------------------------------------------

--
-- Table structure for table `pma_table_uiprefs`
--

CREATE TABLE IF NOT EXISTS `pma_table_uiprefs` (
  `username` varchar(64) NOT NULL,
  `db_name` varchar(64) NOT NULL,
  `table_name` varchar(64) NOT NULL,
  `prefs` text NOT NULL,
  `last_update` timestamp NOT NULL DEFAULT CURRENT_TIMESTAMP ON UPDATE CURRENT_TIMESTAMP,
  PRIMARY KEY (`username`,`db_name`,`table_name`)
)
  COMMENT='Tables'' UI preferences'
  DEFAULT CHARACTER SET utf8 COLLATE utf8_bin;

Pak se odhlásit a přihlásit z phpmyadmina a warning zmizí.

řešení zde